La sécurité doit évidemment être le premier souci dans le cas d’un site de stockage géologique du CO₂.

Cela concerne pendant la durée de l’injection les installations de surface : captage, transport, injection. Cela concerne également à court terme et à long terme le site de stockage en lui-même : les fuites doivent être évitées, ou à défaut leurs effets doivent être atténués sous le seuil de danger   pour l’Homme et l’environnement.