En cas de fuite il faut évaluer les impacts dus au CO₂ mais aussi aux autres substances. Ces autres substances sont communément appelées impuretés. Il peut s’agir des impuretés injectées avec le CO₂ (en effet, le CO₂ capté n’est jamais pur à 100%). Il peut également s’agir d’impuretés présentes dans le sous-sol (radon, sulfures…) et entrainées par le flux et/ou des impuretés provenant de réactions chimiques avec les composants présents dans le sous-sol. Peu de données existent concernant ces impuretés.

Les recherches actuelles dans le cadre du stockage géologique de CO₂ se concentrent principalement sur les effets du H₂S. Le H₂S est considérablement plus toxique que le CO₂ car la valeur maximale d’exposition est de 5 ppm (ou 0,0005 %) soit une valeur mille fois inférieure à celle du CO₂ (5 000 ppm ou 0,5 %).

L’INERIS met en ligne sur son site internet des fiches de données toxicologiques et environnementales rassemblant l’état des connaissances sur les effets de nombreux composés chimiques sur l’homme et les êtres vivants.